Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setd1bQ8CFT2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms