Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ercc8Q8CFD5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ercc8Q8CFD5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ercc8Q8CFD5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ercc8Q8CFD5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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