Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms