Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup88Q8CEC0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup88Q8CEC0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.9 ms