Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms