Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms