Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Nhlrc3Q8CCH2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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