Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms