Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms