Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf4Q8CB96 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms