Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf2Q8CB19 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phtf2Q8CB19 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms