Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nlrp4bQ8C6J9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nlrp4bQ8C6J9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nlrp4bQ8C6J9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nlrp4bQ8C6J9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nlrp4bQ8C6J9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nlrp4bQ8C6J9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nlrp4bQ8C6J9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4bQ8C6J9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms