Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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