Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms