Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C5C9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8C5C9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms