Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms