Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FarsaQ8C0C7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FarsaQ8C0C7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FarsaQ8C0C7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FarsaQ8C0C7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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FarsaQ8C0C7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FarsaQ8C0C7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FarsaQ8C0C7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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