Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka5Q8C050 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka5Q8C050 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms