Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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