Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx17Q8BVL3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms