Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms