Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms