Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms