Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms