Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c2Q8BL74 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms