Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms