Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms