Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms