Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8BGC1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms