Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IfneQ80ZF2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms