Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Lrfn4Q80XU8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Lrfn4Q80XU8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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