Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pcsk9Q80W65 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pcsk9Q80W65 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pcsk9Q80W65 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pcsk9Q80W65 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pcsk9Q80W65 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pcsk9Q80W65 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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