Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms