Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc29Q80VM3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttc29Q80VM3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ttc29Q80VM3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc29Q80VM3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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