Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Avl9Q80U56 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Avl9Q80U56 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Avl9Q80U56 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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