Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms