Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms