Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Clec18aQ7TSQ1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Clec18aQ7TSQ1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec18aQ7TSQ1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Clec18aQ7TSQ1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Clec18aQ7TSQ1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Clec18aQ7TSQ1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Clec18aQ7TSQ1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Clec18aQ7TSQ1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Clec18aQ7TSQ1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Clec18aQ7TSQ1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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