Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdh8Q7TSK3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh8Q7TSK3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms