Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnf1Q7TSH7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnf1Q7TSH7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms