Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms