Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms