Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms