Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rph3alQ768S4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rph3alQ768S4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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