Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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