Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms