Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms