Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd4Q6ZPR5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms