Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis3Q6XP49 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Glis3Q6XP49 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms