Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtifQ6PEE2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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